目前，人们所理解的特许经营就是“经营模式特许经营”，这种经营模式被称为第二代特许经营模式，是现在特许经营中最普遍、最主要的类型。它不仅要求加盟店、经营总店的产品和服务，而且要求加盟店的质量标准、经营方针等都要按照特许者规定的方式进行。加盟方缴纳加盟费和后继不断的权利金(特许权使用费)，这些经费使得特许方能够为加盟方提供培训、广告、研究开发和后续支持。那么，作为加盟方，首先要清楚通常有几种特许经营的费用，以便在投资时量力而行。
加盟费
加盟费是特许方将特许经营权授予加盟方时所收取的一次性费用，它包括加盟方获使用特许方开发出来的商标、专有技术等所支付的费用，这部分费用不会退还，要区别于抵押金。加盟费体现了加盟方加入特许系统所得到的各种好处的价值，一经缴纳意味着被加盟者可以使用特许者的品牌及无形资产。
加盟费在众多加盟企业中，费用的相差悬殊，从不同的行业，不同的企业规模来看，加盟费从几千元、几万元、十几万元到几百万元不等，如重庆风光实业有限公司的加盟金在4000元至9800元；普兰德机器干洗衣物的洗染店加盟金是2万元；咸亨酒店加盟金12万元；九头鸟酒店管理有限责任公司加盟金为48万元；而洋快餐肯德基的加盟金是800万元。
特许权使用费
特许权使用费是被特许者在使用特许经营权过程中按一定的标准或比例向特许方定期支付的费用。在实际当中，特许权使用费按一定金额标准支付的情况较为多见，因为按比例支付会让特许方很难掌控。一般情况下，特许权使用费按年支付，这部分费用也是不可忽视的，有时会与加盟费不相上下。
如重庆风光实业有限公司的特许权使用费是2800元，为加盟金的一半左右；普兰德机器干洗衣物的洗染店特许权使用费3000元至5000元，是加盟费的1/4；咸亨酒店特许权使用费是10万元，接近于加盟费；九头鸟酒店管理有限责任公司特许权使用费为销售额的3%；肯德基的特许权使用费为销售额的6%。
保证金
为确保被特许者履行特许经营合同，特许方可要求加盟方交付一定的保证金，这部分费用到合同期满后，在加盟方没有违约行为，没有不清楚款项的情况时，特许方务必退还给加盟方。但是，保证金不是每个特许者都收取的，也没有什么收取的标准。有的特许方收取的加盟费较多，有的是象征意义上收取一点，有的为了体现对加盟者的信任，干脆就不收取了。还拿上几家公司来举例，重庆风光实业有限公司的保证金是300元至600元；普兰德机器干洗衣物的洗染店的保证金是2万元，而咸亨酒店、九头鸟酒店管理有限责任公司就不收取保证金。
其他费用
还有一些特许方根据特许经营合同为加盟方提供相关服务，向加盟方收取的费用。如店铺设计及施工费、培训费、广告宣传费、设备租赁费、财务业务费、意外保险费等。这些费用对于每个特许企业都是有一定标准的，在谈加盟事宜的时候，特许方会向加盟方介绍清楚，或者加盟方主动询问特许方，避免在合作进程中因临时出现费用而引起不愉快。
分摊的广告宣传和促销费用
特许总部与加盟者之间是有部分费用是需要双方共同承担的，最常见的是广告宣传和促销费用。
广告宣传和促销费用的分摊方式分为三个层次：
全国性(整体性)广告宣传和促销费用。在全国或者某个区域全面发布的广告宣传和促销费用，由总部规划，整体促销，产生的费用由各店分摊。如果广告宣传促销针对的是特许方的产品，则加盟方不须分摊费用。
区域性广告宣传。如果是区域性的广告宣传，在区域内发展特许经营时，可将此部分费用作为约定的内容写入合约并按时收取，做到区域宣传费用由所在区域分摊。很多特许总部是给加盟方区域授权的权利的，即加盟方可以在一定区域内发展其他加盟者，而在这个区域内的广告宣传和促销费用，就只是在区域内各加盟者之间分摊。
加盟方独立促销。如果针对一家加盟店的促销，则其费用须由该加盟方负担。不过，在特许者独立促销之前，可向总部表明宣传意向，看是否能获得宣传支持，如遇特许总部也有意做广告宣传和促销活动，岂不是两全其美。
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